تساعد عملية تشكيل اللجان على تخطي الفواصل بين الوحدات التنظيمية المختلفة، وتحقيق قرارات جماعية متكاملة في المواضيع ذات العلاقة مما يساعد على سرعة إنجاز العمل وتحقيق الأهداف المنشودة، وترتبط الوكالة بعدد من اللجان منها الداخلية الخاصة بالوكالة والإدارات التابعة لها، وكذلك اللجان الخارجية التنسيقية التي ترتبط بالوكالة وجهات أخرى بالجامعة وفيما يلي قائمة بهذه اللجان:

1. رئيس اللجنة الدائمة لتحديد احتياجات الأماكن.
2. رئيس اللجنة الدائمة لاسكان منسوبي الجامعة.
3. رئيس اللجنة الدائمة لمتابعة الأمن والسلامة .
4. رئيس اللجنة الدائمة للشؤون المالية.
5. رئيس اللجنة الدائمة لغرض التحضير المبكر للاحتفال باليوم الوطني.
6. رئيس اللجنة الدائمة لفحص العروض لمنافسات الجامعة .
7. رئيس اللجنة الدائمة للوثائق بالجامعة.
8. رئيس لجنة دراسة حالات تأمين الخدمة الهاتفية المتنقلة الرسمية للمسؤولين بالجامعة.
9. رئيس لجنة دراسة توصيات ندوة واقع الفساد الإداري .
10. رئيس لجنة لمتابعة حالات الطوارئ التي قد تحدث خلال فصل الشتاء.
11. رئيس لجنة السيارات.
12. رئيس لجنة حصر أراضي ومباني الجامعة.

1. عضو في اللجنة الدائمة للتحول الرقمي.
2. عضو في اللجنة العليا الدائمة لمتابعة الجودة الشاملة والتقويم الاكاديمي.
3. عضو في اللجنة الاشرافية لجائزة عضو هيئة التدريس المتميز (نقاطي).
4. عضو في اللجنة الرئيسية لمتابعة تنفيذ وتطوير مشروعات المدينة الجامعية.
5. عضو في اللجنة العليا لمتابعة موضوع إعادة تأهيل المباني الخاصة بالطالبات.
6. عضو في اللجنة العليا لمتابعة تشغيل المستشفى الجامعي.
7. عضو في اللجنة العليا لدراسة وضع آلية لإستثمار منشآت الجامعة.
8. عضو في اللجنة العليا للخطة الإستراتيجية 2020 لجامعة الملك فيصل.
9. عضو في لجنة التعاملات الإلكترونية الحكومية بالجامعة.
10. عضو في اللجنة العليا للاستثمار وتنمية إيرادات الجامعة.
11. عضو في اللجنة العليا للاشراف على ورشة عمل الجوجوبا جامعة الملك فيصل بالتعاون مع شركة أرامكو.
12. عضو في اللجنة العليا لمتابعة تشغيل المستشفى الجامعي.