برامج الدراسات العليا
بلغ مجموع برامج الدراسات العليا التي تقدمها كليات الجامعة (45) برنامجاً دراسياً ، موزعة على النحو التالي :

الطب:
تمنح الجامعة درجة زمالة جامعة الملك فيصل في التخصصات السريرية، بالإضافة إلى أربعة برامج لمنح الماجستير والدكتوراه والدبلوم ، على النحو التالي :
- طب الأسرة والمجتمع
- جراحة الأنف والأذن والحنجره
- علم الأمراض السريري
- جراحة المخ والأعصاب
- طب المخ والأعصاب
- الدكتوراة فى علم وظائف الأعضاء
- الماجستير فى الطب المهني والصحة المهنية
-   دبلوم الطب الباطني
- الأمراض الباطنية
- الأمراض النفسية
- طب الأمراض الجلدية
- الجراحة العامة
- الأشعة التشخيصية
- الماجستير فى وظائف الأعضاء
- الماجستير فى الكيمياء الحيوية
-   طب الأطفال
- علم أمراض الأنسجة
- أمراض النساء والولادة
- طب وجراحة العيون
- علوم التخدير
- الماجستير فى مورفولوجيا الإنسان
- الدبلوم في طب الأسرة والمجتمع
 
العمارة والتخطيط:
تقدم كلية العمارة والتخطيط أربعة برامج لمنح درجة الماجستير في التخصصات التالية:
- التخطيط الحضري والإقليمي
- تنسيق المواقع
- العمارة (طلاب + طالبات)
- علوم وتقنية البناء

العلوم الزراعية والأغذية:
تقدم كلية العلوم الزراعيةً برامج لمنح درجة الماجستير في التخصصات التالية:
- المحاصيل والمراعي
- الاقتصاد والإرشاد الزراعي
- الأراضي والمياه
- الاقتصاد المنزلي ( طالبات ) : ( الغذاء والتغذية ، الأسرة ونمو الطفل ، الاقتصاد المنزلي التربوي )
- علوم الأغذية
- الإنتاج الحيواني
- وقاية النبات
- الهندسة الزراعية

الطب البيطري والثروة الحيوانية :
تقدم الكلية ثلاث برامج لمنح درجة الماجستير في التخصصات التالية :
- صحة الحيوان ( التشخيص المخبري أو الطب الوقائي )
- التشريح البيطري
- التناسليات والتلقيح الاصطناعي ونقل الأجنة

كلية التربية :
تقدم الكلية خمسة برامج لمنح درجة الماجستير في التخصصات التالية:
- التوجيه والإرشاد النفسي
- اللغويات التطبيقية ( اللغة الإنجليزية )
- اللغة العربية ( الأدب ، والنقد ، واللغويات )
- الإدارة التربوية
- دبلوم التوجيه والارشاد الطلابي

كلية العلوم الإدارية والتخطيط :
تقدم الكلية برنامجاً واحداً لمنح درجة الماجستير في تخصص :
- إدارة الأعمال

كلية العلوم :
تقدم الكلية برنامجين لمنح درجة الماجستير في تخصص :
- الرياضيات
- الفيزياء

كلية التمريض :
تقدم الكلية برنامجاً واحداً لمنح درجة الدبلوم العالي في تخصص :
- القبالة