تم تحديد أهداف محطة التدريب والأبحاث الزراعية والبيطرية في نسق متجانس مع أهداف الجامعة الرئيسية, لذا يمكن تلخيص أهداف المحطة على النحو التالي:-
التدريب الطلابي:
التدريب العملي لطلاب الجامعة لكافة التخصصات المتنوعة في مجالات العلوم الزراعية و الأغذية و الطب البيطري و الثروة الحيوانية و بما يحقق تأهيلهم تأهيلاً علمياً و ميدانياً يرتقي بهم للمساهمة في تطوير القطاع الزراعي بشقيه النباتي والحيواني, وما يستخدم من قطاعات أخرى مثل الطب والهندسة والعلوم والصيدلة، كما يشمل هذا الهدف تنظيم المشاهدات الميدانية و برامج الدروس العملية للملتحقين بالدورات التدريبية التخصصية و التي تعقد في الجامعة عموماً و المحطة خصوصاً أو الإدارات الحكومية ذات العلاقة بهذه المجالات في المحافظة.
البحث العلمي:
تعتبر المحطة الموقع الرئيسي بالجامعة لإجراء البحوث التطبيقية لحل المشاكل الزراعية و البيطرية في جميع المجالات بالمملكة العربية السعودية بصفة عامة و المنطقة الشرقية بصفة خاصة، حيث يقوم أعضاء هيئة التدريس و الباحثون بالجامعة و طلاب الدراسات العليا بإجراء أبحاثهم ذاتية التمويل أو المدعومة سواءً عن طريق عمادة البحث العلمي بالجامعة أو من خارج الجامعة ممثلة غالباً في مدينة الملك عبدالعزيز للعلوم والتقنية، الشركة السعودية للصناعات الأساسية (سابك) أو المؤسسات الأخرى المهتمة بالأبحاث الزراعية و البيطرية. ويبرز دور المحطة في تسهيل مهمة الباحثين عموماً بما فيهم منسوبي المحطة و دعمهم معنوياً بالكوادر الفنية الماهرة التي تعمل في المحطة و تأمين بعض مستلزمات البحث من حقول زراعية أو حظائر حيوانية أو بيوت محمية و آليات و معدات زراعية لإنجاز كافة الأعمال الأساسية مثل حراثة الحقول و تهيئتها و الري و التسميد و تأمين الحيوانات و رعايتها و خلاف ذلك في ظل الإمكانات المتوفرة في المحطة.
بالإضافة إلى معمل التحليل الكيميائي الذي يقدم خدماته في مجال تحليل التربة والنبات والمياه.
خدمة المجتمع:
تقوم المحطة بالمساهمة في خدمة المجتمع عن طريق تقديم الاستشارات العلمية و الخدمات الفنية فيما يعود على المجتمع بالفائدة و يزيد من وعي المواطن بالشئون الزراعية و البيطرية والمجالات الأخرى، و يهتم القائمون على المحطة بزيادة وعي المواطنين و المهتمين بالشئون الزراعية بشقيها النباتي والحيواني عن طريق استصدار نشرات علمية ذات طابع إرشادي بالتعاون مع ذوي الاختصاص من أعضاء هيئة التدريس بالجامعة ومنسوبي المحطة.
وتسعى إدارة المحطة مع إدارة الجامعة في إيجاد آلية تنفيذية لبيع منتجات المحطة لمنسوبي الجامعة كافة ولأبناء المجتمع بما يعود بالمنفعة للمحطة لصرفها بالجهود الذاتية على صيانة جميع الوحدات الموجودة بها.